中心源于1996年海南琼海师范学校电教中心，1999年更名为琼海师范学校信息技术中心，2003年更名为海南软件职业技术学院实验中心，隶属科研设备处。2006年9月更名为计算机应用技术实验教学中心，作为学院直属二级教学及管理单位。中心现有教职工108人，主要承担全院的计算机应用课程的实验实训教学。